Евгений, параллельное включение варикапов - нормальное явление. Видел много схем с подобным включением.
Ожидается ухудшение добротности, но для увода частоты кварцевого резонатора - можно попробовать.
На более низких частотах, при отсутствии варикапов, используют даже ёмкость стабилитронов!
Сам собирал приёмник прямого преобразования на 80 метров, где в гетеродине, в качестве варикапа стоял Д814 стабилитрон

И всё работало. Правда, гетеродин там работал на частоте вдвое ниже, чем частота приёма - в районе 1.8 мГц.
Это так, для информации

Если КВ109 имеете 8 шт, то можно попробовать и встречно-параллельное включение - 4 шт в параллель с одной стороны, 4 шт в параллель - с другой. Всё должно работать.
Ну, а по поводу изменений тактовой частоты и программы в целом, то моё мнение, что лучше же, конечно, повторить, для начала, точную копию авторского варианта трансивера, а уж потом, если заработает - заниматься его модернизациями и улучшениями.

С нетерпением ждём результатов эксперимента!